RNA–Protein interactions for RNA: YNL035C

YNL035C, Transcript of Nuclear protein of unknown function, yeast

Gene YNL035C, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL035C	YNL035C	MDL2	P33311	773 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	SPC29	P33419	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	GIC1	P38785	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	GYP8	P43570	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	TRP3	P00937	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	CDC9	P04819	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	TOM20	P35180	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	YKR073C	P36153	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	YER158C	P40095	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	GYP7	P48365	746 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	MTC3	P53077	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	SFB2	P53953	876 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	RSC58	Q07979	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	MED7	Q08278	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL035C	YNL035C	RAD18	P10862	487 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	CHS2	P14180	963 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	AIM26	P32858	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	GTS1	P40956	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YGR130C	P53278	816 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SDH1	Q00711	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
YNL035C	YNL035C	SRT1	Q03175	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	ENV7	Q12003	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SVS1	Q12254	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	ACE2	P21192	770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	PTC7	P38797	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	RRT14	P40470	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YGR237C	P50089	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	HFM1	P51979	1187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	THI73	Q07904	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	TRE1	Q08919	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	NUP145	P49687	1317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SRD1	P09007	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	PER1	P25625	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	FUN30	P31380	1131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	EMC3	P36039	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	TOS1	P38288	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	PEX7	P39108	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YJR008W	P47085	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	NIT3	P49954	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	DAM1	P53267	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	MET7	Q08645	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	OSW2	Q12202	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
YNL035C	YNL035C	LIP5	P32875	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	MTC2	P34246	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	PMT3	P47190	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	RSC3	Q06639	885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	XYL2	Q07993	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	NSI1	Q12457	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SPS1	P08458	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	RFC5	P38251	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YKE2	P52553	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	UME1	Q03010	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	ATP25	Q03153	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SSY1	Q03770	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	CYC7	P00045	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	MET13	P53128	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL035C	YNL035C	SFL1	P20134	766 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	DAL7	P21826	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	PCL2	P25693	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	APL1	P27351	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
YNL035C	YNL035C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	YAP1801	P38856	637 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	MGS1	P40151	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	TAD1	P53065	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	FOL1	P53848	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	MCD4	P36051	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	CAF16	P43569	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	CTH1	P47976	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	GPG1	P53130	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	TMA17	Q12513	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	ADP1	P25371	1049 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL035C	YNL035C	YCL002C	P25565	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 113.4 ms