RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	SEC8	P32855	1065 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	STE13	P33894	931 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	HCS1	P34243	683 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	OCT1	P35999	772 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YKR075C	P36155	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	CCC2	P38995	1004 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YGL176C	P46945	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ATG17	Q06410	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PCL8	Q08966	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SEC2	P17065	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MRPL25	P23369	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	KIP1	P28742	1111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MRE11	P32829	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YKL222C	P35995	705 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MAM1	P40065	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YAP5	P40574	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	IOC3	P43596	787 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ATP25	Q03153	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	CSI1	Q04368	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	HFD1	Q04458	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RMP1	Q12530	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MAL33	P38157	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	VMA22	P38784	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	FCY21	P40039	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PHB1	P40961	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	GCD10	P41814	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ATG36	P46983	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	KEL2	P50090	882 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MON1	P53129	644 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ULP1	Q02724	621 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	NSE1	Q07913	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ALR1	Q08269	859 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ELG1	Q12050	791 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	BBP1	Q12365	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	GCN3	P14741	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	REC107	P21651	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
SKG6	YHR149C	MSH2	P25847	964 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SIN4	P32259	974 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ACP1	P32463	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PEP7	P32609	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SMC1	P32908	1225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	DUR3	P33413	735 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MRPL40	P36534	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	APD1	P38281	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SWD1	P39706	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	XKS1	P42826	600 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	NNT1	Q05874	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	APC5	Q08683	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	OSW1	Q08692	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	TAF10	Q12030	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	HSP42	Q12329	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	NMT1	P14743	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YRO2	P38079	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	IFA38	P38286	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PEX18	P38855	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PIK1	P39104	1066 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ALG2	P43636	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	DIP5	P53388	608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SWP1	Q02795	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	VPS16	Q03308	798 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ATG13	Q06628	738 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	OPY2	Q06810	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RSA1	Q08932	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SNA3	P14359	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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