RNA–Protein interactions for RNA: YDR174W

HMO1, Transcript of Chromatin associated high mobility group (HMG) family member, yeast

Gene HMO1, Length 741 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMO1	YDR174W	HMI1	Q12039	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	CDC20	P26309	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	FLR1	P38124	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	EAF1	Q06337	982 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	UBX5	Q06682	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	RXT3	Q07458	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	ADE8	P04161	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	SRP101	P32916	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	ERT1	P38140	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	OCA5	P38738	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	IOC3	P43596	787 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	TIM54	P47045	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	YGR012W	P53206	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	YAP6	Q03935	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	BDF2	Q07442	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	TPO1	Q07824	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	ESC8	Q08119	714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMO1	YDR174W	HSF1	P10961	833 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	ENA1	P13587	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	EMC1	P25574	760 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YRO2	P38079	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CCC2	P38995	1004 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	MET12	P46151	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	GCV2	P49095	1034 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	HUL5	P53119	910 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	LCD1	Q04377	747 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	NSE3	Q05541	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YLR358C	O13565	187 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CIT1	P00890	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	SPE1	P08432	466 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	ARE1	P25628	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CDC11	P32458	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	POA1	P38218	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	TOK1	P40310	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	TAF1	P46677	1066 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
HMO1	YDR174W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	TAF8	Q03750	510 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	FLC1	Q08967	793 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	PET10	P36139	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YBR284W	P38150	797 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	HIS5	P07172	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
HMO1	YDR174W	YCR015C	P25616	317 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	SCT1	P32784	759 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	LST4	P34239	828 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	TOP3	P13099	656 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	REC104	P33323	182 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CHA4	P43634	648 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	STE11	P23561	717 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CTS1	P29029	562 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	BET3	P36149	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	GIP4	P39732	760 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	TMA10	Q06177	86 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	PPM2	Q08282	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HMO1	YDR174W	CAN1	P04817	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	STE13	P33894	931 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	ATG19	P35193	415 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	PLB1	P39105	664 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	HUL4	P40985	892 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	RTA1	P53047	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	RPN4	Q03465	531 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	ENV7	Q12003	364 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	GAL11	P19659	1081 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	YKL222C	P35995	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
HMO1	YDR174W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	NCS6	P53088	359 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	FBP1	P09201	348 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	STE14	P32584	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HMO1	YDR174W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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