RNA–Protein interactions for RNA: YBL043W

ECM13, Transcript of Non-essential protein of unknown function, yeast

Gene ECM13, Length 774 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM13	YBL043W	LYP1	P32487	611 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	OAR1	P35731	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	OSW7	P43611	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YML122C	Q03207	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
ECM13	YBL043W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	PPM2	Q08282	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YAP1801	P38856	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	NSE3	Q05541	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	AIM39	Q08223	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	AGP1	P25376	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	MOH1	P38191	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	OSW2	Q12202	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YGR012W	P53206	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	BDF2	Q07442	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	RAD4	P14736	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YKL069W	P36088	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	SHE9	Q04172	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	CDA1	Q06702	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	RKM4	Q12504	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	SPE1	P08432	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	INO1	P11986	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	MRP8	P35719	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	TIM54	P47045	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	RPN4	Q03465	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	SPO75	Q07798	868 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	ENB1	Q08299	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	LAS17	Q12446	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM13	YBL043W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
ECM13	YBL043W	YKL107W	P34251	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YKL151C	P36059	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	IRR1	P40541	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	MDM38	Q08179	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	NPC2	Q12408	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	PPG1	P32838	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	NCS6	P53088	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	HUL5	P53119	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	SCT1	P32784	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	SRP101	P32916	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	VBA5	P36172	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	PBY1	P38254	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YBR184W	P38299	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	BUL1	P48524	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	UBA2	P52488	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	RNH70	P53331	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	SRT1	Q03175	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	HSF1	P10961	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ECM13	YBL043W	BRN1	P38170	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	CCC2	P38995	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YGL176C	P46945	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	ERP6	P53198	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	ESC2	Q06340	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	FUN30	P31380	1131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	GIC1	P38785	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	FLC1	Q08967	793 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	CIT2	P08679	460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	GAL11	P19659	1081 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	KAR4	P25583	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	STE5	P32917	917 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	ATG19	P35193	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	BUD6	P41697	788 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	TPO2	P53283	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	DOS2	P54858	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	EAF1	Q06337	982 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	FMP25	Q08023	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	GUP2	Q08929	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	ARE1	P25628	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM13	YBL043W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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