RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.95■■■□□ 2.55
PPP1CC-211ENST00000620030 ST5P78524 1137 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 NGEFQ8N5V2 710 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF3CO14782 793 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 NPHP1O15259 732 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF181Q9P0P0 153 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 SRGNP10124 158 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 MYL6BP14649 208 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.9■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 CHL1O00533 1208 aa30.9■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 RASSF7Q02833 373 aa30.9■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 ERBB4Q15303 1308 aa30.9■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 PRELPP51888 382 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 PDIA6Q15084 440 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 STYK1Q6J9G0 422 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP1CC-211ENST00000620030 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.88■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 CNKSR1Q969H4 720 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 MASTLQ96GX5 879 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 NFKBIEO00221 500 aa30.86■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 C21orf2O43822 256 aa30.86■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 LMNB1P20700 586 aa30.86■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM177BA6PVY3 158 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 SBF1O95248 1867 aa30.83■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PPP1CC-211ENST00000620030 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 PROSER3Q2NL68 480 aa30.81■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 NPR1P16066 1061 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 KRT24Q2M2I5 525 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 NYXQ9GZU5 481 aa30.79■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 APAF1O14727 1248 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 ANXA1P04083 346 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 TOMM70O94826 608 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 GPTP24298 496 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 SUSD4Q5VX71 490 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 NECTIN2Q92692 538 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 CFAP44Q96MT7 982 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC184Q52MB2 194 aa30.76■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.76■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.75■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 SLX4Q8IY92 1834 aa30.75■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 ERFEQ4G0M1 354 aa30.75■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 NUP98P52948 1817 aa30.75■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF853P0CG23 659 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 SOGA3Q5TF21 947 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 RRAGCQ9HB90 399 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 HSPA6P17066 643 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 CRY2Q49AN0 593 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 COPS6Q7L5N1 327 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCC12Q96J65 1359 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 GLTPD2A6NH11 291 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 NTSR2O95665 410 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 HOXB7P09629 217 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 ALDH1B1P30837 517 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 MBIPQ9NS73 344 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 PARP10Q53GL7 1025 aa30.7■■■□□ 2.51
PPP1CC-211ENST00000620030 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.69■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.68■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.68■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC93Q567U6 631 aa30.67■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.67■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.67■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 IFT57Q9NWB7 429 aa30.67■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 OLFM4Q6UX06 510 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.65■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 GNAI1P63096 354 aa30.65■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC10A5Q5PT55 438 aa30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.3 ms