RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591994.1

RPRD1A-210, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 2

Gene RPRD1A, Length 2,484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-210	ENST00000591994	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	ATP9B	O43861	1147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	TXLNA	P40222	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	KCNQ4	P56696	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	SIX5	Q8N196	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	APBA3	O96018	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	MDFI	Q99750	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RPRD1A-210	ENST00000591994	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	GATA4	P43694	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	SEC13	P55735	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	CLDN10	P78369	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	IER5	Q5VY09	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	PCSK7	Q16549	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	SFI1	A8K8P3	1242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ADH7	P40394	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	FURIN	P09958	794 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	EPB42	P16452	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	RASA1	P20936	1047 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	IGFBP4	P22692	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994		A6NJR5	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	C9orf172	C9J069	976 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	CHRNA4	P43681	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	TYRO3	Q06418	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	RTN1	Q16799	776 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994		M0R082	166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	DKK1	O94907	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-210	ENST00000591994	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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