RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 CNBD1Q8NA66 436 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 LBX1P52954 281 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 LDHDQ86WU2 507 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 CNKSR1Q969H4 720 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 MASTLQ96GX5 879 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 SETDB2Q96T68 719 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 WBP1LQ9NX94 342 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 USP16Q9Y5T5 823 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 SLC51AQ86UW1 340 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 COL4A5P29400 1685 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 LTBP1Q14766 1721 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 ST5P78524 1137 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 TEFQ10587 303 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC93Q567U6 631 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 NPHP1O15259 732 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 EPHX2P34913 555 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 SNED1Q8TER0 1413 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 FAM177BA6PVY3 158 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 HACL1Q9UJ83 578 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 RASSF10A6NK89 507 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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PTPRS-208ENST00000590509 CNTROBQ8N137 903 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 AIDAQ96BJ3 306 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 ABHD8Q96I13 439 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 NBPF26B4DH59 902 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 SLC34A2O95436 690 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 FAM161AQ3B820 660 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 SOGA3Q5TF21 947 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRS-208ENST00000590509 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
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PTPRS-208ENST00000590509 NPR1P16066 1061 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRS-208ENST00000590509 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRS-208ENST00000590509 SYNE4Q8N205 404 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRS-208ENST00000590509 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRS-208ENST00000590509 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
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PTPRS-208ENST00000590509 SCNN1DP51172 638 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTPRS-208ENST00000590509 CAPNS2Q96L46 248 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRS-208ENST00000590509 AOC2O75106 756 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRS-208ENST00000590509 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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PTPRS-208ENST00000590509 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.53■■□□□ 1.04
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