RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589235.5

CIRBP-222, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-222	ENST00000589235	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	STYK1	Q6J9G0	422 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	TOMM70	O94826	608 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	MASTL	Q96GX5	879 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	NGEF	Q8N5V2	710 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	RASSF7	Q02833	373 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	SRGN	P10124	158 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	HSPA6	P17066	643 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	SOGA3	Q5TF21	947 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	C21orf2	O43822	256 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIRBP-222	ENST00000589235	MYL6B	P14649	208 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	HLF	Q16534	295 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	NPR1	P16066	1061 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	NFKBIE	O00221	500 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	RRAGC	Q9HB90	399 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.83	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	ALDH1B1	P30837	517 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	CHL1	O00533	1208 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	APLP1	P51693	650 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	PRELP	P51888	382 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	CCDC93	Q567U6	631 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	SBF1	O95248	1867 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	FSTL1	Q12841	308 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CIRBP-222	ENST00000589235	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	GPT	P24298	496 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	PDIA6	Q15084	440 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	SUSD4	Q5VX71	490 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	HOXB7	P09629	217 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	CRY2	Q49AN0	593 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	CFAP44	Q96MT7	982 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
CIRBP-222	ENST00000589235	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.7	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	COPS6	Q7L5N1	327 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	SLX4	Q8IY92	1834 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	NLRP3	Q96P20	1036 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	NTSR2	O95665	410 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	ANXA1	P04083	346 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	PROSER3	Q2NL68	480 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIRBP-222	ENST00000589235	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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