RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP10DQ9P241 1426 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHL1O00533 1208 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANXA1P04083 346 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 ST5P78524 1137 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRS2Q9HD23 443 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDE6BP35913 854 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 PROSER3Q2NL68 480 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCORQ6W2J9 1755 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTLL6Q8N841 843 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADCY9O60503 1353 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERBB4Q15303 1308 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDIA6Q15084 440 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPTP24298 496 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFAP44Q96MT7 982 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 MBIPQ9NS73 344 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGL2O15211 777 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 RASSF7Q02833 373 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CTDNEP1-207ENST00000572043 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 COPS6Q7L5N1 327 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFT57Q9NWB7 429 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF181Q9P0P0 153 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 C21orf2O43822 256 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF853P0CG23 659 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRGNP10124 158 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNAI1P63096 354 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUSD4Q5VX71 490 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 MASTLQ96GX5 879 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERFEQ4G0M1 354 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 STYK1Q6J9G0 422 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNKSR1Q969H4 720 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 NYXQ9GZU5 481 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCC12Q96J65 1359 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1QTNF8P60827 252 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOXB7P09629 217 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.08■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 NFKBIEO00221 500 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPR1P16066 1061 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRELPP51888 382 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF428Q96B54 188 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 WWC1Q8IX03 1113 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 NTSR2O95665 410 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 LMNB1P20700 586 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC27Q2M243 656 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 PARP10Q53GL7 1025 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-207ENST00000572043 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCIRG1Q13488 830 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 OLFM4Q6UX06 510 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 TSPYL6Q8N831 410 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 HYPKQ9NX55 129 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF3CO14782 793 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 NLRP10Q86W26 655 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLBD2Q8NHP8 589 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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