RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	ARX	Q96QS3	562 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	CACNA1F	O60840	1977 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	TM4SF1	P30408	202 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	DDR1	Q08345	913 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	ATP10D	Q9P241	1426 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX19B-215	ENST00000569224	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	VAMP4	O75379	141 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	NFIX	Q14938	502 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	HLF	Q16534	295 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	COPS6	Q7L5N1	327 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	HYPK	Q9NX55	129 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	SERPINB2	P05120	415 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	ADCY9	O60503	1353 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	G2E3	Q7L622	706 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
DDX19B-215	ENST00000569224	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	FLII	Q13045	1269 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	LAMB2	P55268	1798 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	GPT	P24298	496 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	NTSR2	O95665	410 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	TGFB2	P61812	414 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	ST5	P78524	1137 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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