RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 KIF3CO14782 793 aa29.93■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 ST5P78524 1137 aa29.91■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 NGEFQ8N5V2 710 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 HLFQ16534 295 aa29.89■■■□□ 2.38
PPP4C-212ENST00000567828 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.88■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.371e-7■■□□□ 13.3
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 RGL2O15211 777 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 MYL6BP14649 208 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 PRELPP51888 382 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 NEUROD2Q15784 382 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 FAM177BA6PVY3 158 aa29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 NFKBIEO00221 500 aa29.84■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 C21orf2O43822 256 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 SRGNP10124 158 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 LMNB1P20700 586 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 RUNDC1Q96C34 613 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-212ENST00000567828 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 STYK1Q6J9G0 422 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 MASTLQ96GX5 879 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 CNKSR1Q969H4 720 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.79■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.79■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.79■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 ERBB4Q15303 1308 aa29.78■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 HSPA6P17066 643 aa29.78■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.78■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
PPP4C-212ENST00000567828 TOMM70O94826 608 aa29.76■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC12Q96J65 1359 aa29.75■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 ANXA1P04083 346 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 NPR1P16066 1061 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 GPTP24298 496 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 PDIA6Q15084 440 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 RRAGCQ9HB90 399 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.73■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 PROSER3Q2NL68 480 aa29.73■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.73■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.73■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 NECTIN2Q92692 538 aa29.73■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 KRT24Q2M2I5 525 aa29.72■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 NYXQ9GZU5 481 aa29.72■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 CHL1O00533 1208 aa29.71■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.71■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.71■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PPP4C-212ENST00000567828 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 GLTPD2A6NH11 291 aa29.69■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 ERFEQ4G0M1 354 aa29.69■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 SOGA3Q5TF21 947 aa29.69■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 WDR90Q96KV7 1748 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 LAMB2P55268 1798 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 SUSD4Q5VX71 490 aa29.67■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.67■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 OLFM4Q6UX06 510 aa29.66■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC93Q567U6 631 aa29.65■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 NTSR2O95665 410 aa29.64■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 CRY2Q49AN0 593 aa29.64■■■□□ 2.34
PPP4C-212ENST00000567828 APAF1O14727 1248 aa29.63■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 COPS6Q7L5N1 327 aa29.63■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.63■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 ALDH1B1P30837 517 aa29.62■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 PARP10Q53GL7 1025 aa29.61■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.61■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP44Q96MT7 982 aa29.61■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.61■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms