RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP44Q96MT7 982 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE6BP35913 854 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 H0YIN7 160 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPHP1O15259 732 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOXB7P09629 217 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 ST5P78524 1137 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC184Q52MB2 194 aa22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRS2Q9HD23 443 aa22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYL6BP14649 208 aa22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFT57Q9NWB7 429 aa22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNAI1P63096 354 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 NGEFQ8N5V2 710 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLL6Q8N841 843 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF853P0CG23 659 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPA6P17066 643 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDIA6Q15084 440 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLFQ16534 295 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFFO2Q5TF58 517 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC27Q2M243 656 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP98P52948 1817 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 NYXQ9GZU5 481 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 MBIPQ9NS73 344 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 STYK1Q6J9G0 422 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF3CO14782 793 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRGNP10124 158 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT24Q2M2I5 525 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNKSR1Q969H4 720 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROSER3Q2NL68 480 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 MASTLQ96GX5 879 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARP10Q53GL7 1025 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 NECTIN2Q92692 538 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 COPS6Q7L5N1 327 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANXA1P04083 346 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPR1P16066 1061 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 WWC1Q8IX03 1113 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 HYPKQ9NX55 129 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL16Q14005 1332 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM177BA6PVY3 158 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPTP24298 496 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOGA3Q5TF21 947 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 SBF1O95248 1867 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 NTSR2O95665 410 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMNB1P20700 586 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRY2Q49AN0 593 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUSD4Q5VX71 490 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF181Q9P0P0 153 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC12Q96J65 1359 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH1B1P30837 517 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERFEQ4G0M1 354 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 C21orf2O43822 256 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOMM70O94826 608 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCIRG1Q13488 830 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.1■■□□□ 1.13
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