RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.7■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.7■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.7■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.69■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.69■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.68■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANXA1P04083 346 aa28.68■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERPINB2P05120 415 aa28.68■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.68■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SETDB2Q96T68 719 aa28.67■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.67■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.66■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.66■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP98P52948 1817 aa28.65■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TGFB2P61812 414 aa28.65■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP10DQ9P241 1426 aa28.65■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLGA2Q08379 1002 aa28.64■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HLFQ16534 295 aa28.64■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSPYL6Q8N831 410 aa28.64■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.64■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HYPKQ9NX55 129 aa28.64■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.63■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COPS6Q7L5N1 327 aa28.63■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.63■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNBD1Q8NA66 436 aa28.59■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.58■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.58■■■□□ 2.17
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPHP1O15259 732 aa28.57■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 E9PSI1 815 aa28.56■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR162Q16538 588 aa28.56■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.56■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STK31Q9BXU1 1019 aa28.56■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.55■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPEP1P16444 411 aa28.55■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ST5P78524 1137 aa28.55■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.55■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A0G2JLW4 131 aa28.54■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.54■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.54■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.53■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.53■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.53■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.53■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.52■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VAMP4O75379 141 aa28.52■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPTP24298 496 aa28.52■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PARP10Q53GL7 1025 aa28.52■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NYXQ9GZU5 481 aa28.52■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.52■■■□□ 2.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDE6BP35913 854 aa28.51■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLFN5Q08AF3 891 aa28.5■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM177BA6PVY3 158 aa28.49■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNA3P22001 575 aa28.49■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHRNA5P30532 468 aa28.49■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCIRG1Q13488 830 aa28.49■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.49■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CACNA1FO60840 1977 aa28.49■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRIN3BO60391 1043 aa28.48■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.48■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIM2Q9P1W9 311 aa28.48■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUSD4Q5VX71 490 aa28.47■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.47■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.47■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.46■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.45■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.45■■■□□ 2.15
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NTSR2O95665 410 aa28.45■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC4A2P04920 1241 aa28.45■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.45■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.44■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NLRP10Q86W26 655 aa28.44■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCS1LQ9Y276 419 aa28.44■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC12Q96J65 1359 aa28.44■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.43■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.42■■■□□ 2.14
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