RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 VAMP4O75379 141 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 COPS6Q7L5N1 327 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHL34Q8N239 644 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCN7AQ01118 1682 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 HYPKQ9NX55 129 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCORQ6W2J9 1755 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYT17Q9BSW7 474 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC4A2P04920 1241 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 SERPINB2P05120 415 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 G2E3Q7L622 706 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 SETDB2Q96T68 719 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 STK31Q9BXU1 1019 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM177BA6PVY3 158 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPTP24298 496 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUP98P52948 1817 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF428Q96B54 188 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGL2O15211 777 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 TCIRG1Q13488 830 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUSD4Q5VX71 490 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP10DQ9P241 1426 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 FLIIQ13045 1269 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A0G2JLW4 131 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNBD1Q8NA66 436 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPHP1O15259 732 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADCY9O60503 1353 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 DPEP1P16444 411 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 KSR2Q6VAB6 950 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYD88Q99836 296 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHRNA5P30532 468 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 NLRP10Q86W26 655 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 UTRNP46939 3433 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERFEQ4G0M1 354 aa22.33■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.33■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 NTSR2O95665 410 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNA3P22001 575 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 TGFB2P61812 414 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYNE4Q8N205 404 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 F6X3S4 739 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 ST5P78524 1137 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 PARP10Q53GL7 1025 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 CACNA1FO60840 1977 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 NYXQ9GZU5 481 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.3 ms