RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 SPINT1O43278 529 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 NCAPD3P42695 1498 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 PLA2G4AP47712 749 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 HPS1Q92902 700 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 IFT43Q96FT9 208 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 ITGAEP38570 1179 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 ZAP70P43403 619 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 C4orf17Q53FE4 359 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 GJD3Q8N144 294 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 KLK14Q9P0G3 267 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 ZBTB39O15060 712 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 PCSK2P16519 638 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 DSC3Q14574 896 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 GPR182O15218 404 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 IGHA2P01877 340 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 TXLNAP40222 546 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 EHHADHQ08426 723 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 FAM26DQ5JW98 314 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 ATCAYQ86WG3 371 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 POLIQ9UNA4 740 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 PDGFAP04085 211 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 ATP2B2Q01814 1243 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 PLCB3Q01970 1234 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 WDR44Q5JSH3 913 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 IER5Q5VY09 327 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 TREML1Q86YW5 311 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 EDEM1Q92611 657 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 TCF3P15923 654 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 MAPK8P45983 427 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 RNF217Q8TC41 542 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 BMP2P12643 396 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 AIDAQ96BJ3 306 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 RECKO95980 971 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 TTC16Q8NEE8 873 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 BCS1LQ9Y276 419 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 RGS20O76081 388 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 MICAL2O94851 1124 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 NEFLP07196 543 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 ATP4AP20648 1035 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 PHKA2P46019 1235 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 GPR152Q8TDT2 470 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 SUSD3Q96L08 255 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 SMARCA2P51531 1590 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GTH6 734 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 SCARF1Q14162 830 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 FBF1Q8TES7 1133 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 CUX2O14529 1486 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 ARSDP51689 593 aa9.38□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 POU4F2Q12837 409 aa9.38□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.38□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 ERCC6Q03468 1493 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 TTLL8A6PVC2 850 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 AVPP01185 164 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 IDH3AP50213 366 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 MRS2Q9HD23 443 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 HMGXB3Q12766 1538 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.4 ms