RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 SETDB2Q96T68 719 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-204ENST00000558376 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 POTEIP0CG38 1075 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 POTEJP0CG39 1038 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 SRGNP10124 158 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 STYK1Q6J9G0 422 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 CNBD1Q8NA66 436 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 USP16Q9Y5T5 823 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 CHADLQ6NUI6 762 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 CNKSR1Q969H4 720 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 BCORQ6W2J9 1755 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 MASTLQ96GX5 879 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 BTBD11A6QL63 1104 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 ST5P78524 1137 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 CREBZFQ9NS37 354 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 NPHP1O15259 732 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 PRKAR2BP31323 418 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RABGGTA-204ENST00000558376 SCN4AP35499 1836 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 NBPF26B4DH59 902 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 SOGA3Q5TF21 947 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 OLFM4Q6UX06 510 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 NBPF15Q8N660 670 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 MRS2Q9HD23 443 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 PASKQ96RG2 1323 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 NPR1P16066 1061 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 CCDC93Q567U6 631 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 MCM10Q7L590 875 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 RALBP1Q15311 655 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 LDHDQ86WU2 507 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 CNTNAP1P78357 1384 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 FOXN1O15353 648 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 DCTN1Q14203 1278 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM177BA6PVY3 158 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 HLFQ16534 295 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 CFAP53Q96M91 514 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-204ENST00000558376 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 VEGFBP49765 207 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 SYNE4Q8N205 404 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 HACL1Q9UJ83 578 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 NUDCQ9Y266 331 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 RGL2O15211 777 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 EPHX2P34913 555 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 FZD9O00144 591 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 PPP2R1AP30153 589 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 NUP98P52948 1817 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 SNED1Q8TER0 1413 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 ABCC12Q96J65 1359 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 ALDH1B1P30837 517 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 NGEFQ8N5V2 710 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 CNTROBQ8N137 903 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 WBP1LQ9NX94 342 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 COL4A5P29400 1685 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms