RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 TEFQ10587 303 aa15.36■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.36■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 SETDB2Q96T68 719 aa15.36■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 BCORQ6W2J9 1755 aa15.36■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 SCN4AP35499 1836 aa15.36■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 CACNA1SQ13698 1873 aa15.35■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
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CS-221ENST00000550734 POTEJP0CG39 1038 aa15.35■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 SOGA3Q5TF21 947 aa15.35■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 CNBD1Q8NA66 436 aa15.35■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.35■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 A1BGP04217 495 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 RALBP1Q15311 655 aa15.34■□□□□ 0.05
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CS-221ENST00000550734 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 MASTLQ96GX5 879 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CS-221ENST00000550734 PASKQ96RG2 1323 aa15.34■□□□□ 0.05
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CS-221ENST00000550734 ST5P78524 1137 aa15.33■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.32■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.32■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 CNTNAP1P78357 1384 aa15.32■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 LDHDQ86WU2 507 aa15.31■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 RGL2O15211 777 aa15.3■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.3■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 USP16Q9Y5T5 823 aa15.3■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.29■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 BTBD11A6QL63 1104 aa15.29■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 FOXN1O15353 648 aa15.29■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 KCNQ3O43525 872 aa15.29■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 CCDC93Q567U6 631 aa15.29■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.29■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 NPHP1O15259 732 aa15.28■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 NPR1P16066 1061 aa15.28■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.27■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.27■□□□□ 0.04
CS-221ENST00000550734 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 VEGFBP49765 207 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 FZD9O00144 591 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 NEFMP07197 916 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
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CS-221ENST00000550734 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
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CS-221ENST00000550734 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 WBP1LQ9NX94 342 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 HACL1Q9UJ83 578 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 SNED1Q8TER0 1413 aa15.25■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 NBPF26B4DH59 902 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 EPHX2P34913 555 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 NBPF15Q8N660 670 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 RASSF10A6NK89 507 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 ALDH1B1P30837 517 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 NFE2L2Q16236 605 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 OLFM4Q6UX06 510 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 DCTN1Q14203 1278 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 GPC2Q8N158 579 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 AIDAQ96BJ3 306 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 CRY2Q49AN0 593 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 CNTROBQ8N137 903 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 SYNE4Q8N205 404 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 PSMD1Q99460 953 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-221ENST00000550734 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.21■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 HLFQ16534 295 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 LBX1P52954 281 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CS-221ENST00000550734 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.18■□□□□ 0.02
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