RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 WBP1LQ9NX94 342 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 MRC1P22897 1456 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 POTECB2RU33 542 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 GYS1P13807 737 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 VEGFBP49765 207 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 SLFN5Q08AF3 891 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 CHADLQ6NUI6 762 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 MBIPQ9NS73 344 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-218ENST00000550159 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 SLC39A6Q13433 755 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ATG3Q9NT62 314 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ADRA2BP18089 450 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ZNF521Q96K83 1311 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ZNF853P0CG23 659 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ITGB4P16144 1822 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 A0A087WZG4 1122 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 C4AP0C0L4 1744 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ERBB4Q15303 1308 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 POTEIP0CG38 1075 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 POTEJP0CG39 1038 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 SBF1O95248 1867 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 TMEM88BA6NKF7 163 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 RPS6KA4O75676 772 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 MS4A1P11836 297 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 DDR1Q08345 913 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 KIF6Q6ZMV9 814 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 HYPKQ9NX55 129 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-218ENST00000550159 FKBP8Q14318 412 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 PASKQ96RG2 1323 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 ZNF652Q9Y2D9 606 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 KIF16BQ96L93 1317 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 NFKBIEO00221 500 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 KCNQ3O43525 872 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 ZPR1O75312 459 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 ERFEQ4G0M1 354 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 LDHDQ86WU2 507 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 TTLL6Q8N841 843 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 NECTIN2Q92692 538 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 DDNO94850 711 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 SLC4A2P04920 1241 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 MYL6BP14649 208 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 NPHP1O15259 732 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 VAMP4O75379 141 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 PTPRCP08575 1304 aa12.21□□□□□ -0.45
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