RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 EXOC6Q8TAG9 804 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 COG6Q9Y2V7 657 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 RPS6KA4O75676 772 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 FKBP8Q14318 412 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 AKT1S1Q96B36 256 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 C4AP0C0L4 1744 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 BCORQ6W2J9 1755 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 CAMTA2O94983 1202 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 BAG6P46379 1132 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 HLFQ16534 295 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 BEND3Q5T5X7 828 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 AK7Q96M32 723 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 SCN7AQ01118 1682 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ATP10DQ9P241 1426 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 PHF14O94880 888 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 DDX58O95786 925 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 IGKV5-2P06315 115 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 MYD88Q99836 296 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NEFLP07196 543 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ARXQ96QS3 562 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 MS4A1P11836 297 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 CCDC125Q86Z20 511 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 MEIS3Q99687 375 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NUP98P52948 1817 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ERVV-1B6SEH8 477 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 GPTP24298 496 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 TCIRG1Q13488 830 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 LINS1Q8NG48 757 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NARFQ9UHQ1 456 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 A0A087WZG4 1122 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ADRA2BP18089 450 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 SSFA2P28290 1259 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 USP44Q9H0E7 712 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ALDH1L1O75891 902 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 RFC4P35249 363 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 CASP7P55210 303 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 GCKRQ14397 625 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 SLC15A2Q16348 729 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 UTRNP46939 3433 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 GYS1P13807 737 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 NLRP10Q86W26 655 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-216ENST00000549221 SYNE4Q8N205 404 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms