RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 COL15A1P39059 1388 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 KAZALD1Q96I82 304 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 SUCLG2Q96I99 432 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 H7C1W4 665 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 SURF6O75683 361 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-209ENST00000547449 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 SEC24BO95487 1268 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 TTC22Q5TAA0 569 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 STAP2Q9UGK3 403 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 APBB1O00213 710 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 CASP7P55210 303 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 TCIRG1Q13488 830 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 SALL3Q9BXA9 1300 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 A0A087WZG4 1122 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 PDE1AP54750 535 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 KIF6Q6ZMV9 814 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ERC1Q8IUD2 1116 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ERVV-1B6SEH8 477 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 AOX1Q06278 1338 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 CDC45O75419 566 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ATP6V1AP38606 617 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 SIK1P57059 783 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 COPRSQ9NQ92 184 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 AFF2P51816 1311 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 MSH5O43196 834 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 KCNQ2O43526 872 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 MX1P20591 662 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 EIF5P55010 431 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 FOXO4P98177 505 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-209ENST00000547449 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 SDSP20132 328 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 TBC1D32Q96NH3 1257 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 PALLDQ8WX93 1383 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 ITGB4P16144 1822 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 ATRNO75882 1429 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 ITPK1Q13572 414 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 SASH1O94885 1247 aa12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 HLFQ16534 295 aa12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 LMBR1LQ6UX01 489 aa12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 C22orf23Q9BZE7 217 aa12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12□□□□□ -0.49
CS-209ENST00000547449 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms