RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 POM121CA8CG34 1229 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 EFSO43281 561 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 TEAD4Q15561 434 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 NCAPD3P42695 1498 aa8.76□□□□□ -1.01
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TRDN-205ENST00000546248 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.75□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 TNS4Q8IZW8 715 aa8.75□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.75□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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TRDN-205ENST00000546248 EML1O00423 815 aa8.74□□□□□ -1.01
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TRDN-205ENST00000546248 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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TRDN-205ENST00000546248 MARK1Q9P0L2 795 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 PIK3R2O00459 728 aa8.73□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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TRDN-205ENST00000546248 CD163Q86VB7 1156 aa8.73□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.73□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 FURINP09958 794 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 CHRNA4P43681 627 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 LAMC2Q13753 1193 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 WWC1Q8IX03 1113 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 TRIM11Q96F44 468 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 UCN2Q96RP3 112 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRDN-205ENST00000546248 A6NJR5 290 aa8.71□□□□□ -1.02
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TRDN-205ENST00000546248 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.71□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.71□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 USP17L3A6NCW0 530 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 USP17L4A6NCW7 530 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRDN-205ENST00000546248 SYT9Q86SS6 491 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 TRIM50Q86XT4 487 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 MDFIQ99750 246 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 SERTM1A2A2V5 107 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 CCDC102BQ68D86 513 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 ELOA3Q8NG57 546 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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TRDN-205ENST00000546248 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.68□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 SLC30A3Q99726 388 aa8.68□□□□□ -1.02
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TRDN-205ENST00000546248 ATP1A2P50993 1020 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 ABCC8Q09428 1581 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 HMGXB3Q12766 1538 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 ATP9BO43861 1147 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 SIN3BO75182 1162 aa8.66□□□□□ -1.02
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TRDN-205ENST00000546248 POTEAQ6S8J7 498 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 OGFOD1Q8N543 542 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 DKK1O94907 266 aa8.65□□□□□ -1.02
TRDN-205ENST00000546248 SFI1A8K8P3 1242 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.64□□□□□ -1.03
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TRDN-205ENST00000546248 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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TRDN-205ENST00000546248 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ARID3CA6NKF2 412 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 C21orf2O43822 256 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 SPEM2Q0P670 501 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 SIX5Q8N196 739 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 TNFRSF25Q93038 417 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 M0R2N6 131 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.62□□□□□ -1.03
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