RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 ERBB4Q15303 1308 aa22.82■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 TM4SF1P30408 202 aa22.82■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.82■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 DDR1Q08345 913 aa22.81■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 GOLGA2Q08379 1002 aa22.81■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.81■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 NFIXQ14938 502 aa22.8■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.8■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.8■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 ADCY9O60503 1353 aa22.79■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 HLFQ16534 295 aa22.79■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.79■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 COPS6Q7L5N1 327 aa22.78■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.78■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 SLFN5Q08AF3 891 aa22.77■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.77■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 SCN7AQ01118 1682 aa22.77■■□□□ 1.24
LATS1-205ENST00000542720 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.76■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 VAMP4O75379 141 aa22.75■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.75■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 BCORQ6W2J9 1755 aa22.75■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.75■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 E9PSI1 815 aa22.74■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.74■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.73■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 SERPINB2P05120 415 aa22.73■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.73■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.73■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 HYPKQ9NX55 129 aa22.72■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 SETDB2Q96T68 719 aa22.71■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.71■■□□□ 1.23
LATS1-205ENST00000542720 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.7■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 KIF3CO14782 793 aa22.69■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 NUP98P52948 1817 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 FAM177BA6PVY3 158 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 RGL2O15211 777 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 GPTP24298 496 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 G2E3Q7L622 706 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 SLC4A2P04920 1241 aa22.67■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.67■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 STK31Q9BXU1 1019 aa22.67■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.67■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.66■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.66■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.66■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.66■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.66■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.65■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.65■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.64■■□□□ 1.22
LATS1-205ENST00000542720 A0A0G2JLW4 131 aa22.63■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 TCIRG1Q13488 830 aa22.63■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 SUSD4Q5VX71 490 aa22.63■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 ZNF428Q96B54 188 aa22.63■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.63■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.62■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.62■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 DPEP1P16444 411 aa22.61■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 TGFB2P61812 414 aa22.61■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 CNBD1Q8NA66 436 aa22.61■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 NPHP1O15259 732 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 CHRNA5P30532 468 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 APLP1P51693 650 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.6■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.59■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 KCNA3P22001 575 aa22.59■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 FLIIQ13045 1269 aa22.59■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.59■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.58■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 NLRP10Q86W26 655 aa22.58■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.58■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.58■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.58■■□□□ 1.21
LATS1-205ENST00000542720 NTSR2O95665 410 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-205ENST00000542720 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LATS1-205ENST00000542720 ST5P78524 1137 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-205ENST00000542720 ERFEQ4G0M1 354 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-205ENST00000542720 PARP10Q53GL7 1025 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-205ENST00000542720 KSR2Q6VAB6 950 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms