RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	ZBBX	A8MT70	800 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	ITGB7	P26010	798 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	CENPC	Q03188	943 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	PAX4	O43316	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	MSX1	P28360	303 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	TXK	P42681	527 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	CTBS	Q01459	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	C2CD2L	O14523	706 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	BNIP3L	O60238	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	RAPGEF3	O95398	923 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	USP17L8	P0C7I0	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	NLRP8	Q86W28	1048 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6	3e-7	■■■■□ 25.8
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM182B	Q5T319	152 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	TRAK2	O60296	914 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	C4orf17	Q53FE4	359 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	KIAA0556	O60303	1618 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPL48-208	ENST00000537007	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TOM1	O60784	492 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	THBS1	P07996	1170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	MLEC	Q14165	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM11	Q96F44	468 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	NCOA1	Q15788	1441 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	UACA	Q9BZF9	1416 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	FANCA	O15360	1455 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	C9orf172	C9J069	976 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	SCTR	P47872	440 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	XAGE2	Q96GT9	111 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	IL2RA	P01589	272 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	PLA2G4A	P47712	749 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	NEUROD1	Q13562	356 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	TLR1	Q15399	786 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ELOA3	Q8NG57	546 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	AIDA	Q96BJ3	306 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	ALK	Q9UM73	1620 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXO45	P0C2W1	286 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	CD33	P20138	364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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