RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 PRELPP51888 382 aa24.38■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 TTLL6Q8N841 843 aa24.38■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.38■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.37■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 H0YIN7 160 aa24.37■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 APLP1P51693 650 aa24.37■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.36■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.36■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.36■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 CAMTA2O94983 1202 aa24.35■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 RRAGCQ9HB90 399 aa24.35■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.34■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 NFKBIEO00221 500 aa24.34■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 LMNB1P20700 586 aa24.34■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 SLX4Q8IY92 1834 aa24.33■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 NPHP1O15259 732 aa24.33■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 CCDC27Q2M243 656 aa24.33■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 CNBD1Q8NA66 436 aa24.33■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 USP16Q9Y5T5 823 aa24.33■■□□□ 1.49
PUF60-218ENST00000531995 HTRA3P83110 453 aa24.32■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 PDE6BP35913 854 aa24.3■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 WWC1Q8IX03 1113 aa24.3■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 SETDB2Q96T68 719 aa24.3■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.3■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 C21orf2O43822 256 aa24.29■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 CHL1O00533 1208 aa24.28■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 ZNF853P0CG23 659 aa24.28■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 ST5P78524 1137 aa24.28■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.27■■□□□ 1.48
PUF60-218ENST00000531995 FSTL1Q12841 308 aa24.26■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 PCNTO95613 3336 aa24.26■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 IFFO2Q5TF58 517 aa24.25■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 GLTPD2A6NH11 291 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 NBPF26B4DH59 902 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 NBPF15Q8N660 670 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 CFAP44Q96MT7 982 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 ZNF521Q96K83 1311 aa24.24■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 NGEFQ8N5V2 710 aa24.23■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.23■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.23■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 NUP98P52948 1817 aa24.22■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 FAM177BA6PVY3 158 aa24.21■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 SRGNP10124 158 aa24.21■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 STYK1Q6J9G0 422 aa24.21■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.21■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 IFT57Q9NWB7 429 aa24.21■■□□□ 1.47
PUF60-218ENST00000531995 ERFEQ4G0M1 354 aa24.2■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 WDR63Q8IWG1 891 aa24.2■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 CNKSR1Q969H4 720 aa24.2■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 MBIPQ9NS73 344 aa24.2■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 MASTLQ96GX5 879 aa24.19■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 IL16Q14005 1332 aa24.18■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 GNAI1P63096 354 aa24.18■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 KRT24Q2M2I5 525 aa24.18■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.18■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.17■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 KLRG1Q96E93 195 aa24.17■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 HLFQ16534 295 aa24.16■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 ABCC12Q96J65 1359 aa24.16■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 POTECB2RU33 542 aa24.15■■□□□ 1.46
PUF60-218ENST00000531995 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 NPR1P16066 1061 aa24.13■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 SOGA3Q5TF21 947 aa24.13■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.13■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 OLFM4Q6UX06 510 aa24.13■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 CCDC93Q567U6 631 aa24.12■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.11■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 MYL6BP14649 208 aa24.1■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.1■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 SCN4AP35499 1836 aa24.1■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 RGL2O15211 777 aa24.09■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.09■■□□□ 1.45
PUF60-218ENST00000531995 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.09■■□□□ 1.45
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