RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530628.2

CDKN2A-210, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDKN2A, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-210ENST00000530628 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.31■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.29■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 NEFMP07197 916 aa29.28■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.28■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 CNKSR1Q969H4 720 aa29.28■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.28■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.28■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 SLX4Q8IY92 1834 aa29.27■■■□□ 2.28
CDKN2A-210ENST00000530628 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 STYK1Q6J9G0 422 aa29.26■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.26■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.26■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 MASTLQ96GX5 879 aa29.25■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 SRGNP10124 158 aa29.24■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 HTRA3P83110 453 aa29.24■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 ERFEQ4G0M1 354 aa29.23■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 NBPF26B4DH59 902 aa29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 SOGA3Q5TF21 947 aa29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 NBPF15Q8N660 670 aa29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.21■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.2■■■□□ 2.27
CDKN2A-210ENST00000530628 RGL2O15211 777 aa29.2■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.2■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 KLRG1Q96E93 195 aa29.2■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.17■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 POTECB2RU33 542 aa29.16■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 FAM177BA6PVY3 158 aa29.15■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 NPR1P16066 1061 aa29.15■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.14■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CDKN2A-210ENST00000530628 NUP98P52948 1817 aa29.13■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 HLFQ16534 295 aa29.13■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 JMYQ8N9B5 988 aa29.13■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 NFE2L2Q16236 605 aa29.12■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC93Q567U6 631 aa29.12■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 NGEFQ8N5V2 710 aa29.12■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.11■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.1■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CDKN2A-210ENST00000530628 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.07■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 ALDH1B1P30837 517 aa29.07■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 NYXQ9GZU5 481 aa29.07■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.06■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.05■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 MYL6BP14649 208 aa29.05■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.05■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 SCN4AP35499 1836 aa29.04■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 CHADLQ6NUI6 762 aa29.03■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.02■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.02■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CDKN2A-210ENST00000530628 OLFM4Q6UX06 510 aa29.01■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.01■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.99■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 ERBB4Q15303 1308 aa28.98■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 GPTP24298 496 aa28.98■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 RIPK4P57078 832 aa28.98■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 CRY2Q49AN0 593 aa28.98■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC12Q96J65 1359 aa28.98■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 POTEIP0CG38 1075 aa28.97■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 POTEJP0CG39 1038 aa28.97■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 RALBP1Q15311 655 aa28.97■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 SYNE4Q8N205 404 aa28.97■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CDKN2A-210ENST00000530628 SUSD4Q5VX71 490 aa28.95■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.95■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.94■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.94■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 LDHDQ86WU2 507 aa28.94■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.94■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.93■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.93■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 PSMD1Q99460 953 aa28.93■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 CREBZFQ9NS37 354 aa28.93■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.92■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.92■■■□□ 2.22
CDKN2A-210ENST00000530628 FZD9O00144 591 aa28.91■■■□□ 2.22
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