RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527303.1

PLEC-211, Transcript of plectin, humanhuman

TSL 3

Gene PLEC, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-211ENST00000527303 WDR90Q96KV7 1748 aa28.91■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 DCTN1Q14203 1278 aa28.91■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 CNKSR1Q969H4 720 aa28.91■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 NFKBIEO00221 500 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 STYK1Q6J9G0 422 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.89■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.89■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 CACNA1SQ13698 1873 aa28.89■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 SOGA3Q5TF21 947 aa28.88■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 SRGNP10124 158 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 PRELPP51888 382 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 MASTLQ96GX5 879 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 SLX4Q8IY92 1834 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 C21orf2O43822 256 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 NBPF26B4DH59 902 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 NBPF15Q8N660 670 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEC-211ENST00000527303 NFE2L2Q16236 605 aa28.82■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 ERFEQ4G0M1 354 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 IFFO2Q5TF58 517 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 NUP98P52948 1817 aa28.79■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 NPR1P16066 1061 aa28.79■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.79■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.78■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PLEC-211ENST00000527303 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 RALBP1Q15311 655 aa28.76■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 NYXQ9GZU5 481 aa28.75■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 CCDC93Q567U6 631 aa28.74■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.74■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 KLRG1Q96E93 195 aa28.74■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 ALDH1B1P30837 517 aa28.73■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 HLFQ16534 295 aa28.73■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 ERBB4Q15303 1308 aa28.72■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.72■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 POTECB2RU33 542 aa28.71■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.71■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.71■■■□□ 2.19
PLEC-211ENST00000527303 JMYQ8N9B5 988 aa28.7■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.69■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 SCN4AP35499 1836 aa28.69■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.68■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 FAM177BA6PVY3 158 aa28.67■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.67■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 NGEFQ8N5V2 710 aa28.67■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 CRY2Q49AN0 593 aa28.66■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.66■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 RIPK4P57078 832 aa28.65■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 HTRA3P83110 453 aa28.65■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.64■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 MYL6BP14649 208 aa28.64■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.64■■■□□ 2.18
PLEC-211ENST00000527303 PCNTO95613 3336 aa28.63■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.63■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.62■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.61■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 CHADLQ6NUI6 762 aa28.6■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.6■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 ABCC12Q96J65 1359 aa28.6■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 PARP10Q53GL7 1025 aa28.59■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.59■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.59■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 PSMD1Q99460 953 aa28.59■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.58■■■□□ 2.17
PLEC-211ENST00000527303 SUSD4Q5VX71 490 aa28.57■■■□□ 2.16
PLEC-211ENST00000527303 GPTP24298 496 aa28.56■■■□□ 2.16
PLEC-211ENST00000527303 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PLEC-211ENST00000527303 SYNE4Q8N205 404 aa28.56■■■□□ 2.16
PLEC-211ENST00000527303 SNED1Q8TER0 1413 aa28.56■■■□□ 2.16
PLEC-211ENST00000527303 NTSR2O95665 410 aa28.55■■■□□ 2.16
PLEC-211ENST00000527303 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.55■■■□□ 2.16
PLEC-211ENST00000527303 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms