RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
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TSNARE1-208ENST00000524325 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TSNARE1-208ENST00000524325 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
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TSNARE1-208ENST00000524325 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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TSNARE1-208ENST00000524325 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
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TSNARE1-208ENST00000524325 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.86■■■□□ 2.21
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TSNARE1-208ENST00000524325 A0A087WZG4 1122 aa28.83■■■□□ 2.21
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TSNARE1-208ENST00000524325 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.79■■■□□ 2.2
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TSNARE1-208ENST00000524325 ALDH1L1O75891 902 aa28.68■■■□□ 2.18
TSNARE1-208ENST00000524325 SUSD4Q5VX71 490 aa28.68■■■□□ 2.18
TSNARE1-208ENST00000524325 NFIXQ14938 502 aa28.68■■■□□ 2.18
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.68■■■□□ 2.18
TSNARE1-208ENST00000524325 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
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