RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, human

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSNARE1-208	ENST00000524325	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	HLF	Q16534	295 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSNARE1-208	ENST00000524325	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	RREB1	Q92766	1687 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	MYD88	Q99836	296 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	ABCC4	O15439	1325 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	MSH5	O43196	834 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	RFC4	P35249	363 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	CRBN	Q96SW2	442 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	SSFA2	P28290	1259 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325		A0A087WZG4	1122 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TSNARE1-208	ENST00000524325	GPT	P24298	496 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	BEND3	Q5T5X7	828 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	IGKV5-2	P06315	115 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZPR1	O75312	459 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADRA2B	P18089	450 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	FKBP8	Q14318	412 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	MS4A1	P11836	297 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	LINS1	Q8NG48	757 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	NEFL	P07196	543 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	GYS1	P13807	737 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	MEIS3	Q99687	375 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.73	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.7	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	GCKR	Q14397	625 aa		28.7	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.7	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.7	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	USP44	Q9H0E7	712 aa		28.7	■■■□□ 2.19
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	ALDH1L1	O75891	902 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	NFIX	Q14938	502 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TSNARE1-208	ENST00000524325	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18

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