RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 DCTN1Q14203 1278 aa6.99□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.98□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PHKG2P15735 406 aa6.97□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.97□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PEAK1Q9H792 1746 aa6.97□□□□□ -1.29
MSC-AS1-205ENST00000519068 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.97□□□□□ -1.29
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MSC-AS1-205ENST00000519068 COL18A1P39060 1754 aa6.96□□□□□ -1.3
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.96□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 OCEL1Q9H607 264 aa6.96□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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MSC-AS1-205ENST00000519068 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 QPCTQ16769 361 aa6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTC13Q8NBP0 860 aa6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 ALG2Q9H553 416 aa6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.95□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC34A2O95436 690 aa6.94□□□□□ -1.3
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CD46P15529 392 aa6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 SOX11P35716 441 aa6.94□□□□□ -1.3
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MSC-AS1-205ENST00000519068 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCAF5Q96JK2 942 aa6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 SHPRHQ149N8 1683 aa6.93□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP54Q70EL1 1684 aa6.93□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.93□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.93□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHL1O00533 1208 aa6.93□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCNQ3O43525 872 aa6.93□□□□□ -1.3
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCNQ2O43526 872 aa6.93□□□□□ -1.3
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