RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 CACNA1SQ13698 1873 aa32.35■■■□□ 2.77
LAPTM4B-202ENST00000517924 KRT24Q2M2I5 525 aa32.33■■■□□ 2.77
LAPTM4B-202ENST00000517924 TTLL7Q6ZT98 887 aa32.33■■■□□ 2.77
LAPTM4B-202ENST00000517924 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.33■■■□□ 2.77
LAPTM4B-202ENST00000517924 BABAM1Q9NWV8 329 aa32.33■■■□□ 2.77
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF652Q9Y2D9 606 aa32.33■■■□□ 2.77
LAPTM4B-202ENST00000517924 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
LAPTM4B-202ENST00000517924 H0YIN7 160 aa32.32■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHL1O00533 1208 aa32.31■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 NPHP1O15259 732 aa32.31■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.31■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 APAF1O14727 1248 aa32.3■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 TTLL6Q8N841 843 aa32.3■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM177BA6PVY3 158 aa32.29■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 PROSER3Q2NL68 480 aa32.29■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.28■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANXA1P04083 346 aa32.28■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDE6BP35913 854 aa32.28■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDIA6Q15084 440 aa32.28■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 NECTIN2Q92692 538 aa32.28■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.28■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa32.27■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGL2O15211 777 aa32.27■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 ST5P78524 1137 aa32.27■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRP10Q7Z4F1 713 aa32.27■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.27■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLX4Q8IY92 1834 aa32.27■■■□□ 2.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 RASSF7Q02833 373 aa32.26■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 C9orf131Q5VYM1 1079 aa32.26■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERBB4Q15303 1308 aa32.26■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.24■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 C1QTNF8P60827 252 aa32.24■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF6Q6ZMV9 814 aa32.24■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.24■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa32.23■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 SRGNP10124 158 aa32.22■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRELPP51888 382 aa32.21■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 RNF181Q9P0P0 153 aa32.21■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.21■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 GPTP24298 496 aa32.2■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.2■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFAP44Q96MT7 982 aa32.2■■■□□ 2.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.2■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa32.19■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 MBIPQ9NS73 344 aa32.19■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC12Q96J65 1359 aa32.18■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 C21orf2O43822 256 aa32.17■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF853P0CG23 659 aa32.17■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 STYK1Q6J9G0 422 aa32.17■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.17■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 NFKBIEO00221 500 aa32.16■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANP32CO43423 234 aa32.16■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 MASTLQ96GX5 879 aa32.16■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.16■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.15■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 SUSD4Q5VX71 490 aa32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 COPS6Q7L5N1 327 aa32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 MRS2Q9HD23 443 aa32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHPF2Q9P2E5 772 aa32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 TIAM2Q8IVF5 1701 aa32.14■■■□□ 2.74
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF3CO14782 793 aa32.13■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERFEQ4G0M1 354 aa32.13■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 CNKSR1Q969H4 720 aa32.13■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 DUSP27Q5VZP5 1158 aa32.12■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP32.12■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa32.11■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 NMRK2Q9NPI5 230 aa32.11■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 IFT57Q9NWB7 429 aa32.11■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 NPR1P16066 1061 aa32.1■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 NYXQ9GZU5 481 aa32.1■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 LMNB1P20700 586 aa32.09■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 NTSR2O95665 410 aa32.08■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 HOXB7P09629 217 aa32.08■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.73
LAPTM4B-202ENST00000517924 GNAI1P63096 354 aa32.07■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 OLFM4Q6UX06 510 aa32.06■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 C7orf43Q8WVR3 580 aa32.06■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 C3orf67Q6ZVT6 689 aa32.04■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 CRY2Q49AN0 593 aa32.03■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 C8orf58Q8NAV2 365 aa32.03■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF428Q96B54 188 aa32.03■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 LAMB2P55268 1798 aa32.03■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.02■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
LAPTM4B-202ENST00000517924 PARP10Q53GL7 1025 aa32.01■■■□□ 2.71
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms