RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 SETDB2Q96T68 719 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 USP16Q9Y5T5 823 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 CAMTA2O94983 1202 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 CNBD1Q8NA66 436 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-208ENST00000511807 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 NFKBIEO00221 500 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 C21orf2O43822 256 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 PRELPP51888 382 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 FSTL1Q12841 308 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 ST5P78524 1137 aa14.82□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 IFFO2Q5TF58 517 aa14.82□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 NGEFQ8N5V2 710 aa14.82□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 CEP350Q5VT06 3117 aa14.82□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 SCN7AQ01118 1682 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 HTRA3P83110 453 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 GLTPD2A6NH11 291 aa14.8□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 APAF1O14727 1248 aa14.8□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.8□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.8□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 CNKSR1Q969H4 720 aa14.79□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.79□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF26B4DH59 902 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 SRGNP10124 158 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 ERFEQ4G0M1 354 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 STYK1Q6J9G0 422 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF15Q8N660 670 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2B-208ENST00000511807 FAM177BA6PVY3 158 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 NFE2L2Q16236 605 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 MASTLQ96GX5 879 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 RIPK4P57078 832 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 NEUROD2Q15784 382 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 KLRG1Q96E93 195 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 SBF1O95248 1867 aa14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC27Q2M243 656 aa14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 SOGA3Q5TF21 947 aa14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 WDR90Q96KV7 1748 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 NPR1P16066 1061 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 HLFQ16534 295 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 BCORQ6W2J9 1755 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.72□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 POTECB2RU33 542 aa14.72□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC93Q567U6 631 aa14.72□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.71□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 RGL2O15211 777 aa14.71□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 MYL6BP14649 208 aa14.71□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBE2B-208ENST00000511807 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 WWC1Q8IX03 1113 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 JMYQ8N9B5 988 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 OLFM4Q6UX06 510 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 WDR63Q8IWG1 891 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 GPTP24298 496 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ALDH1B1P30837 517 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms