RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-221	ENST00000511747	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	TERF1	P54274	439 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	PTH1R	Q03431	593 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	PSME1	Q06323	249 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	TCHH	Q07283	1943 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	LTN1	O94822	1766 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	LARGE1	O95461	756 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	F13A1	P00488	732 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	UBE2H	P62256	183 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	VPS53	Q5VIR6	699 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	GPATCH3	Q96I76	525 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	NFAT5	O94916	1531 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	EVI5L	Q96CN4	794 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	UVSSA	Q2YD98	709 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	AACS	Q86V21	672 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	GJB2	P29033	226 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	NECTIN1	Q15223	517 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	KCNB2	Q92953	911 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	FIBP	O43427	364 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	DTNB	O60941	627 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	MTMR6	Q9Y217	621 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	GRM8	O00222	908 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	SASH1	O94885	1247 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	KAZALD1	Q96I82	304 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	GC	P02774	474 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	USP25	Q9UHP3	1055 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	ME3	Q16798	604 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	FAM227B	Q96M60	508 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	MAP4K1	Q92918	833 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	PXDN	Q92626	1479 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-221	ENST00000511747	ST3GAL1	Q11201	340 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SH3BP2-221	ENST00000511747	KCNJ4	P48050	445 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SH3BP2-221	ENST00000511747	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SH3BP2-221	ENST00000511747	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SH3BP2-221	ENST00000511747	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SH3BP2-221	ENST00000511747	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SH3BP2-221	ENST00000511747	NECAB1	Q8N987	351 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SH3BP2-221	ENST00000511747	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.36	■■■□□ 2.77

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