RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 MSH5O43196 834 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 GYS1P13807 737 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 FLIIQ13045 1269 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 G2E3Q7L622 706 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 ARXQ96QS3 562 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 MTFR1LQ9H019 292 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.05■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.05■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 PTPRCP08575 1304 aa27.03■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 FKBP8Q14318 412 aa27.03■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 HLFQ16534 295 aa27.03■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 KSR2Q6VAB6 950 aa27.03■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 ATP10DQ9P241 1426 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTN3-202ENST00000511191 ADCY9O60503 1353 aa27.01■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 KIF16BQ96L93 1317 aa27.01■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 BCAR3O75815 825 aa27■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 ZBTB7AO95365 584 aa27■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 RIC3Q7Z5B4 369 aa27■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 TM4SF1P30408 202 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 NUP98P52948 1817 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 TCIRG1Q13488 830 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 NFIXQ14938 502 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 MSL1Q68DK7 614 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.95■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 SETDB2Q96T68 719 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 SPON1Q9HCB6 807 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 MMP10P09238 476 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 PTGER2P43116 358 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 DDR1Q08345 913 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 PARP10Q53GL7 1025 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 F6X3S4 739 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 POLD1P28340 1107 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 MYD88Q99836 296 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 GPTP24298 496 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 BEND3Q5T5X7 828 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 NLRP10Q86W26 655 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 LINS1Q8NG48 757 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTN3-202ENST00000511191 IGKV5-2P06315 115 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM27P14373 513 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 SERPINB2P05120 415 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 ABCC4O15439 1325 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 SUSD4Q5VX71 490 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 ALDH1L1O75891 902 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 NYXQ9GZU5 481 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 NTSR2O95665 410 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ACTN3-202ENST00000511191 LRP5O75197 1615 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms