RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.39□□□□□ -0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-208ENST00000510829 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.38□□□□□ -0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 MCTP1Q6DN14 999 aa13.36□□□□□ -0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 PTMSP20962 102 aa13.36□□□□□ -0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 SGSM2O43147 1006 aa13.35□□□□□ -0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 SASH1O94885 1247 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-208ENST00000510829 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-208ENST00000510829 KAZALD1Q96I82 304 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-208ENST00000510829 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-208ENST00000510829 TMOD3Q9NYL9 352 aa13.35□□□□□ -0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.33□□□□□ -0.28
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RABGEF1-208ENST00000510829 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.32□□□□□ -0.28
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RABGEF1-208ENST00000510829 HIP1O00291 1037 aa13.31□□□□□ -0.28
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RABGEF1-208ENST00000510829 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
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RABGEF1-208ENST00000510829 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM227BQ96M60 508 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 CPA1P15085 419 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 PTH1RQ03431 593 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-208ENST00000510829 RASEFQ8IZ41 740 aa13.29□□□□□ -0.28
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