RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 AACSQ86V21 672 aa20.2■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.2■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 LRRC37A3O60309 1634 aa20.2■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 CABP4P57796 275 aa20.2■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.2■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.2■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.19■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 MEGF6O75095 1541 aa20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 OFD1O75665 1012 aa20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.18■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 GRM8O00222 908 aa20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 PTMSP20962 102 aa20.16■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.16■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 IGKV5-2P06315 115 aa20.16■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.16■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 POLA2Q14181 598 aa20.15■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 PDIA6Q15084 440 aa20.15■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.15■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 HYPKQ9NX55 129 aa20.15■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 MST1RQ04912 1400 aa20.15■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.15■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 MCCP23508 829 aa20.14■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 BRINP3Q76B58 766 aa20.14■□□□□ 0.82
PFKL-211ENST00000498841 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 13.4
PFKL-211ENST00000498841 KAZALD1Q96I82 304 aa20.14■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 TMX3Q96JJ7 454 aa20.14■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.14■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.14■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 CHGBP05060 677 aa20.13■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 HOXB7P09629 217 aa20.13■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 KCNJ4P48050 445 aa20.12■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 EVA1CP58658 441 aa20.12■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 LINS1Q8NG48 757 aa20.12■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 A1BGP04217 495 aa20.12■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 RBSNQ9H1K0 784 aa20.12■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 CNTROBQ8N137 903 aa20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 RAB11FIP3O75154 756 aa20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 RASEFQ8IZ41 740 aa20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 CACNA1FO60840 1977 aa20.1■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 SASH1O94885 1247 aa20.1■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 STAP2Q9UGK3 403 aa20.1■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 A0A087WZG4 1122 aa20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 FAM227BQ96M60 508 aa20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 PTH1RQ03431 593 aa20.08■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.08■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 SLIT3O75094 1523 aa20.08■□□□□ 0.81
PFKL-211ENST00000498841 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.08■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 UQCRHP07919 91 aa20.08■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 ALDH1L1O75891 902 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 GCKRQ14397 625 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 DCAF5Q96JK2 942 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 SLAIN2Q9P270 581 aa20.07■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 ZNF445P59923 1031 aa20.06■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 FSD1Q9BTV5 496 aa20.06■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.06■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.06■□□□□ 0.8
PFKL-211ENST00000498841 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms