RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498594.5

CRAMP1-208, Transcript of cramped chromatin regulator homolog 1, human

TSL 4

Gene CRAMP1, Length 559 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRAMP1-208	ENST00000498594	HOXC9	P31274	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	AMPH	P49418	695 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	MRE11	P49959	708 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594		A0A0G2JLW4	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CYP27B1	O15528	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	COG3	Q96JB2	828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	AK7	Q96M32	723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	TJP1	Q07157	1748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	IGSF3	O75054	1194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	MCM5	P33992	734 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	APLP1	P51693	650 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ITPK1	Q13572	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	E2F4	Q16254	413 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	PIGB	Q92521	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	FYB1	O15117	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	GNPAT	O15228	680 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZMYND10	O75800	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	TOMM70	O94826	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	MMP10	P09238	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	PDE4A	P27815	886 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RIPK4	P57078	832 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ANAPC15	P60006	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	SATB1	Q01826	763 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	RAD50	Q92878	1312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	TULP2	O00295	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	FCHSD2	O94868	740 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	DPEP1	P16444	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	SIK1	P57059	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRAMP1-208	ENST00000498594	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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