RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAMC2Q13753 1193 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELOA3Q8NG57 546 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CABP1Q9NZU7 370 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHA4P54764 986 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYT9Q86SS6 491 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.52□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.52□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L5A8MUK1 530 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EML1O00423 815 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP9BO43861 1147 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC30A3Q99726 388 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIN3BO75182 1162 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCOA4Q13772 614 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEAD4Q15561 434 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C14orf37Q86TY3 774 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF358Q9NW07 568 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM229AH3BQW9 127 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EML3Q32P44 896 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L3A6NCW0 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L4A6NCW7 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DYRK3O43781 588 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALBP02768 609 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFRSF25Q93038 417 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R082 166 aa9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NID1P14543 1247 aa9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOS2P35228 1153 aa9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOD1Q9Y239 953 aa9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.45□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALAS2P22557 587 aa9.44□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTF2IP78347 998 aa9.44□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBCELQ5QJ74 424 aa9.44□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.44□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BACH1O14867 736 aa9.43□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.43□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNS4Q8IZW8 715 aa9.43□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.42□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEAQ6S8J7 498 aa9.42□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.41□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLDN10P78369 228 aa9.41□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRIK4Q16099 956 aa9.41□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.41□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa9.41□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARID3CA6NKF2 412 aa9.4□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADH7P40394 386 aa9.4□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPEM2Q0P670 501 aa9.4□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM50Q86XT4 487 aa9.4□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.4□□□□□ -0.9
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APBA3O96018 575 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNQ4P56696 695 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARTNQ5T4W7 220 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ILDR2Q71H61 639 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DKK1O94907 266 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OGFOD1Q8N543 542 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERTM1A2A2V5 107 aa9.37□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SELPP16109 830 aa9.37□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP1A2P50993 1020 aa9.37□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRE1Q14246 886 aa9.37□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.37□□□□□ -0.91
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms