RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	GNAI3	P08754	354 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	LAMB2	P55268	1798 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	ITPK1	Q13572	414 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	MEIS3	Q99687	375 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	GNAI2	P04899	355 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	MYD88	Q99836	296 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKP4-215	ENST00000494945	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	TRIM37	O94972	964 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	IGHD	P01880	384 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	UTY	O14607	1347 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	EP400	Q96L91	3159 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	COL15A1	P39059	1388 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945		A0A087WZG4	1122 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	GRM8	O00222	908 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	GCKR	Q14397	625 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	HMMR	O75330	724 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	PLSCR1	O15162	318 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	RGL2	O15211	777 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	ARX	Q96QS3	562 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKP4-215	ENST00000494945	KCNQ4	P56696	695 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945		H7C1W4	665 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	GNPAT	O15228	680 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	MTX1	Q13505	466 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	HLF	Q16534	295 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	APBA3	O96018	575 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	ADRA2B	P18089	450 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	CASP7	P55210	303 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKP4-215	ENST00000494945	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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