RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 MYL6BP14649 208 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE6BP35913 854 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CHL1O00533 1208 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ST5P78524 1137 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 HLFQ16534 295 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ERBB4Q15303 1308 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 APAF1O14727 1248 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC184Q52MB2 194 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 TTLL6Q8N841 843 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 SBF1O95248 1867 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
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SH3BP4-211ENST00000493436 CACNA1SQ13698 1873 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM177BA6PVY3 158 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ANP32CO43423 234 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT24Q2M2I5 525 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 PDIA6Q15084 440 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 NECTIN2Q92692 538 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP44Q96MT7 982 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 ANXA1P04083 346 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 PROSER3Q2NL68 480 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 C1QTNF8P60827 252 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 SLX4Q8IY92 1834 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 SRGNP10124 158 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 STYK1Q6J9G0 422 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 MASTLQ96GX5 879 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF181Q9P0P0 153 aa21.8■■□□□ 1.08
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SH3BP4-211ENST00000493436 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 CNKSR1Q969H4 720 aa21.79■■□□□ 1.08
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SH3BP4-211ENST00000493436 MRS2Q9HD23 443 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 MBIPQ9NS73 344 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.79■■□□□ 1.08
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SH3BP4-211ENST00000493436 C21orf2O43822 256 aa21.77■■□□□ 1.08
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SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF853P0CG23 659 aa21.77■■□□□ 1.08
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SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.77■■□□□ 1.08
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SH3BP4-211ENST00000493436 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 COPS6Q7L5N1 327 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 NPR1P16066 1061 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 SUSD4Q5VX71 490 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP4-211ENST00000493436 LMNB1P20700 586 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 ERFEQ4G0M1 354 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP4-211ENST00000493436 PARP10Q53GL7 1025 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP4-211ENST00000493436 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP4-211ENST00000493436 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 ALDH1B1P30837 517 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC27Q2M243 656 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 CRY2Q49AN0 593 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 TCIRG1Q13488 830 aa21.68■■□□□ 1.06
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