RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 IGKV5-2P06315 115 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 ATP8B2P98198 1209 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 HMMRO75330 724 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 LINS1Q8NG48 757 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 ALDH1L1O75891 902 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT4-205ENST00000489835 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 KCNQ2O43526 872 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 ERBB4Q15303 1308 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 FAM182BQ5T319 152 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 AFF2P51816 1311 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 GRM8O00222 908 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 ARXQ96QS3 562 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 SRGAP3O43295 1099 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 SEC24BO95487 1268 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 STARD3NLO95772 234 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 GCKRQ14397 625 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 SUCLG2Q96I99 432 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 BECN1Q14457 450 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 SSH3Q8TE77 659 aa21.39■■□□□ 1.02
PRRT4-205ENST00000489835 KAZALD1Q96I82 304 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 POLA2Q14181 598 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 UTYO14607 1347 aa21.36■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 ATP6V1AP38606 617 aa21.36■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 A0A087WZG4 1122 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.34■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.34■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 SIK1P57059 783 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRRT4-205ENST00000489835 KCNQ4P56696 695 aa21.33■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.33■■□□□ 1.01
PRRT4-205ENST00000489835 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 PALLDQ8WX93 1383 aa21.32■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 ITPK1Q13572 414 aa21.32■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 MTX1Q13505 466 aa21.32■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.32■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.31■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 HLFQ16534 295 aa21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 TJP1Q07157 1748 aa21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.29■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 CASP7P55210 303 aa21.29■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 TCIRG1Q13488 830 aa21.29■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.29■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.28■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.28■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.28■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 ATRNO75882 1429 aa21.28■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 H7C1W4 665 aa21.27■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 TTC22Q5TAA0 569 aa21.27■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.27■■□□□ 1
PRRT4-205ENST00000489835 GPTP24298 496 aa21.27■□□□□ 0.99
PRRT4-205ENST00000489835 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.27■□□□□ 0.99
PRRT4-205ENST00000489835 SIL1Q9H173 461 aa21.27■□□□□ 0.99
PRRT4-205ENST00000489835 RAB11FIP3O75154 756 aa21.26■□□□□ 0.99
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