RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
RPS6KB1-208ENST00000489824 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS6KB1-208ENST00000489824 MASTLQ96GX5 879 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS6KB1-208ENST00000489824 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS6KB1-208ENST00000489824 SRGNP10124 158 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 SOGA3Q5TF21 947 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 BCORQ6W2J9 1755 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 NBPF26B4DH59 902 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 ERFEQ4G0M1 354 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 NBPF15Q8N660 670 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 RGL2O15211 777 aa25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 NFE2L2Q16236 605 aa25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM177BA6PVY3 158 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 IFFO2Q5TF58 517 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1-208ENST00000489824 NPR1P16066 1061 aa25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 NGEFQ8N5V2 710 aa25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 HTRA3P83110 453 aa25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 HLFQ16534 295 aa25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC93Q567U6 631 aa25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR90Q96KV7 1748 aa25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 KLRG1Q96E93 195 aa25.66■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 NYXQ9GZU5 481 aa25.65■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.64■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYL6BP14649 208 aa25.64■■□□□ 1.7
RPS6KB1-208ENST00000489824 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.64■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLX4Q8IY92 1834 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 RALBP1Q15311 655 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 ALDH1B1P30837 517 aa25.62■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.61■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.61■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 POTECB2RU33 542 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 RIPK4P57078 832 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 CACNA1SQ13698 1873 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 GPTP24298 496 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 ERBB4Q15303 1308 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS6KB1-208ENST00000489824 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 JMYQ8N9B5 988 aa25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 OLFM4Q6UX06 510 aa25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 ABCC12Q96J65 1359 aa25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 CHADLQ6NUI6 762 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 CRY2Q49AN0 593 aa25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 SUSD4Q5VX71 490 aa25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 SYNE4Q8N205 404 aa25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1-208ENST00000489824 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 PARP10Q53GL7 1025 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 NEUROD2Q15784 382 aa25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 JDP2Q8WYK2 163 aa25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 PSMD1Q99460 953 aa25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1-208ENST00000489824 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms