RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		22.62	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CHL1	O00533	1208 aa		22.61	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	STYK1	Q6J9G0	422 aa		22.6	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	22.6	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CNKSR1	Q969H4	720 aa		22.6	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXB7	P09629	217 aa		22.59	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		22.59	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SBF1	O95248	1867 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NPHP1	O15259	732 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SRGN	P10124	158 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SOGA3	Q5TF21	947 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MASTL	Q96GX5	879 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NYX	Q9GZU5	481 aa		22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	22.58	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		22.58	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		22.57	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		22.56	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	22.56	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LMNB1	P20700	586 aa		22.56	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	22.56	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP44	Q96MT7	982 aa		22.56	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	22.56	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		22.56	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		22.55	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	22.55	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		22.55	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PDIA6	Q15084	440 aa		22.54	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HLF	Q16534	295 aa		22.54	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	22.54	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		22.54	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		22.54	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		22.54	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NPR1	P16066	1061 aa		22.53	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NEUROD2	Q15784	382 aa		22.53	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	22.53	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		22.53	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		22.53	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF3C	O14782	793 aa		22.52	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP10	Q53GL7	1025 aa		22.52	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		22.52	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF181	Q9P0P0	153 aa		22.52	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		22.52	■■□□□ 1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH1B1	P30837	517 aa		22.51	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		22.51	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MRS2	Q9HD23	443 aa		22.51	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	22.51	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA1S	Q13698	1873 aa		22.51	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		22.51	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF853	P0CG23	659 aa		22.5	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL6B	P14649	208 aa		22.5	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM70	O94826	608 aa		22.49	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	22.49	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CRY2	Q49AN0	593 aa		22.49	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		22.49	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		22.49	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NFKBIE	O00221	500 aa		22.48	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	22.48	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAI1	P63096	354 aa		22.48	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	22.48	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		22.48	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT57	Q9NWB7	429 aa		22.48	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	APAF1	O14727	1248 aa		22.47	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		22.47	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	22.47	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		22.47	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NGEF	Q8N5V2	710 aa		22.47	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	C21orf2	O43822	256 aa		22.46	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	22.46	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC27	Q2M243	656 aa		22.46	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		22.46	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	22.46	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	22.45	■■□□□ 1.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GLTPD2	A6NH11	291 aa		22.45	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		22.45	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		22.45	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		22.44	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		22.44	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NTSR2	O95665	410 aa		22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF7	Q02833	373 aa		22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC93	Q567U6	631 aa		22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	COPS6	Q7L5N1	327 aa		22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HYPK	Q9NX55	129 aa		22.43	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA6	P17066	643 aa		22.42	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TCIRG1	Q13488	830 aa		22.42	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		22.42	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SUSD4	Q5VX71	490 aa		22.42	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		22.42	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MBIP	Q9NS73	344 aa		22.42	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	22.42	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PRELP	P51888	382 aa		22.41	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PROSER3	Q2NL68	480 aa		22.41	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		22.41	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	22.41	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	FSTL1	Q12841	308 aa		22.4	■■□□□ 1.18

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