RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 DDR1Q08345 913 aa22.98■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.98■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.98■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.98■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 SLFN5Q08AF3 891 aa22.97■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.97■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 COPS6Q7L5N1 327 aa22.97■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 HYPKQ9NX55 129 aa22.97■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.97■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.97■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 VAMP4O75379 141 aa22.96■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.96■■□□□ 1.27
SMIM4-202ENST00000476842 HLFQ16534 295 aa22.95■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.95■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 SERPINB2P05120 415 aa22.94■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 KLHL34Q8N239 644 aa22.94■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 SETDB2Q96T68 719 aa22.94■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.93■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.93■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 STK31Q9BXU1 1019 aa22.91■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.89■■□□□ 1.26
SMIM4-202ENST00000476842 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.89■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.89■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 SCN7AQ01118 1682 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 SLC4A2P04920 1241 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 TGFB2P61812 414 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 ATP10DQ9P241 1426 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 TCIRG1Q13488 830 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 BCORQ6W2J9 1755 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 GPTP24298 496 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 PARP10Q53GL7 1025 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 CNBD1Q8NA66 436 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM4-202ENST00000476842 G2E3Q7L622 706 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF428Q96B54 188 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 NYXQ9GZU5 481 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 A0A0G2JLW4 131 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 FAM177BA6PVY3 158 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 ST5P78524 1137 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 SUSD4Q5VX71 490 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 NPHP1O15259 732 aa22.8■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 DPEP1P16444 411 aa22.8■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 FLIIQ13045 1269 aa22.8■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 KSR2Q6VAB6 950 aa22.8■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.8■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.8■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.79■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.79■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 KCNA3P22001 575 aa22.79■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 NLRP10Q86W26 655 aa22.79■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.79■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.79■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.78■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 PDE6BP35913 854 aa22.78■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.78■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.78■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 NTSR2O95665 410 aa22.77■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.77■■□□□ 1.24
SMIM4-202ENST00000476842 H0YIN7 160 aa22.76■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 CHRNA5P30532 468 aa22.76■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 GPR162Q16538 588 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 ERFEQ4G0M1 354 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 MYD88Q99836 296 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 PIM2Q9P1W9 311 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 NUP98P52948 1817 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.74■■□□□ 1.23
SMIM4-202ENST00000476842 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.74■■□□□ 1.23
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