RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476227.1

TTC21B-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, humanhuman

TSL 3

Gene TTC21B, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21B-204ENST00000476227 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.87□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 SERTM1A2A2V5 107 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 TXLNAP40222 546 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 GRIN2CQ14957 1233 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 SIX5Q8N196 739 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 ATP9BO43861 1147 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 HIF1AQ16665 826 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 TRIM11Q96F44 468 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 STRN4Q9NRL3 753 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 DKK1O94907 266 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 NEUROD1Q13562 356 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 CCDC102BQ68D86 513 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 SYT9Q86SS6 491 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC21B-204ENST00000476227 USP17L3A6NCW0 530 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 USP17L4A6NCW7 530 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 TNS4Q8IZW8 715 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 PLVAPQ9BX97 442 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 CHRNA4P43681 627 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 CLDN10P78369 228 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 PSME1Q06323 249 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 XP32Q5T750 250 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 IER5Q5VY09 327 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 GATA4P43694 442 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 ILDR2Q71H61 639 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 OGFOD1Q8N543 542 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 POM121Q96HA1 1249 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 NACC1Q96RE7 527 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 UCN2Q96RP3 112 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 SPEM2Q0P670 501 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 KIAA1024Q9UPX6 916 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 FURINP09958 794 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 TYRO3Q06418 890 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 SLC30A3Q99726 388 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 BRD7Q9NPI1 651 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 POM121CA8CG34 1229 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 C21orf2O43822 256 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 NID1P14543 1247 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 SUSD3Q96L08 255 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TTC21B-204ENST00000476227 M0R082 166 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 APBA3O96018 575 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 ADH7P40394 386 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 SEC13P55735 322 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 PCSK7Q16549 785 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 Q8N3U1 123 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 C9orf172C9J069 976 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 ITGB7P26010 798 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 CEP63Q96MT8 703 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 A6NJR5 290 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 SFI1A8K8P3 1242 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 MAP3K6O95382 1288 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 ALBP02768 609 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 IGFBP4P22692 258 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 RTN1Q16799 776 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC21B-204ENST00000476227 TBCELQ5QJ74 424 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms