RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.51■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 NPHP1O15259 732 aa31.5■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ST5P78524 1137 aa31.5■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 HLFQ16534 295 aa31.5■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 NGEFQ8N5V2 710 aa31.5■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa31.48■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.48■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.47■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MYL6BP14649 208 aa31.47■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ERBB4Q15303 1308 aa31.47■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CHL1O00533 1208 aa31.46■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.46■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.45■■■□□ 2.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.45■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SRGNP10124 158 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF181Q9P0P0 153 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 PDIA6Q15084 440 aa31.42■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 STYK1Q6J9G0 422 aa31.42■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.42■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 MASTLQ96GX5 879 aa31.41■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF3CO14782 793 aa31.4■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RASSF7Q02833 373 aa31.4■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.4■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 CNKSR1Q969H4 720 aa31.4■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM177BA6PVY3 158 aa31.39■■■□□ 2.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 C21orf2O43822 256 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 APAF1O14727 1248 aa31.37■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 PRELPP51888 382 aa31.37■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 SBF1O95248 1867 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NFKBIEO00221 500 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 LMNB1P20700 586 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 KRT24Q2M2I5 525 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 PROSER3Q2NL68 480 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 CFAP44Q96MT7 982 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NYXQ9GZU5 481 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC184Q52MB2 194 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP98P52948 1817 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 ANXA1P04083 346 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NPR1P16066 1061 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NECTIN2Q92692 538 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.32■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 UBN2Q6ZU65 1347 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GPTP24298 496 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SUSD4Q5VX71 490 aa31.3■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 NUTM1Q86Y26 1132 aa31.3■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SLX4Q8IY92 1834 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 HOXB7P09629 217 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF853P0CG23 659 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 COPS6Q7L5N1 327 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 C7orf43Q8WVR3 580 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ERFEQ4G0M1 354 aa31.28■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SOGA3Q5TF21 947 aa31.28■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MBIPQ9NS73 344 aa31.28■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.26■■■□□ 2.6
PPP1CB-208ENST00000455580 TOMM70O94826 608 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 PARP10Q53GL7 1025 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 ALDH1B1P30837 517 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 CRY2Q49AN0 593 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 IFT57Q9NWB7 429 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC12Q96J65 1359 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 NTSR2O95665 410 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 GNAI1P63096 354 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 RRAGCQ9HB90 399 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 CHPF2Q9P2E5 772 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 GLTPD2A6NH11 291 aa31.22■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa31.22■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 ANP32CO43423 234 aa31.21■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa31.21■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 RIC1Q4ADV7 1423 aa31.21■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 HSPA6P17066 643 aa31.2■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC93Q567U6 631 aa31.2■■■□□ 2.59
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa31.2■■■□□ 2.58
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