RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 SBF1O95248 1867 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 NFE2L2Q16236 605 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 DLEC1Q9Y238 1755 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM177BA6PVY3 158 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 SRGNP10124 158 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 STYK1Q6J9G0 422 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 CNKSR1Q969H4 720 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 GLTPD2A6NH11 291 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 FSTL1Q12841 308 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 HLFQ16534 295 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 NGEFQ8N5V2 710 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 MASTLQ96GX5 879 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 HTRA3P83110 453 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 BCORQ6W2J9 1755 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 ERFEQ4G0M1 354 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 SMC1BQ8NDV3 1235 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 RGL2O15211 777 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 NPR1P16066 1061 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 MYL6BP14649 208 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 RALBP1Q15311 655 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 SOGA3Q5TF21 947 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 SLX4Q8IY92 1834 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 POTECB2RU33 542 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 GPTP24298 496 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 RIPK4P57078 832 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 OLFM4Q6UX06 510 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC93Q567U6 631 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB3Q9H5J0 574 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 TIAM2Q8IVF5 1701 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 KLRG1Q96E93 195 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCC12Q96J65 1359 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 IFFO2Q5TF58 517 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 NYXQ9GZU5 481 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 LAMB4A4D0S4 1761 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR90Q96KV7 1748 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ANXA1P04083 346 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ALDH1B1P30837 517 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 PDIA6Q15084 440 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 NEUROD2Q15784 382 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 PROSER3Q2NL68 480 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 CRY2Q49AN0 593 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 SUSD4Q5VX71 490 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 RTKN2Q8IZC4 609 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ERBB4Q15303 1308 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 PCNTO95613 3336 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNA1SQ13698 1873 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 NECTIN2Q92692 538 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF541Q9H0D2 1346 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 POTEIP0CG38 1075 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 POTEJP0CG39 1038 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.51□□□□□ -0.25
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