RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MYL6B	P14649	208 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	DDR1	Q08345	913 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	ATP10D	Q9P241	1426 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241		E9PSI1	815 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	SETDB2	Q96T68	719 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	TGFB2	P61812	414 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	PROSER3	Q2NL68	480 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	TSPYL6	Q8N831	410 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINB2	P05120	415 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	NECTIN2	Q92692	538 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	COPS6	Q7L5N1	327 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL34	Q8N239	644 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	STK31	Q9BXU1	1019 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PTPA-222	ENST00000445241	SLFN5	Q08AF3	891 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	18.83	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	VAMP4	O75379	141 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA1	P04083	346 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	HLF	Q16534	295 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PARP10	Q53GL7	1025 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	CNBD1	Q8NA66	436 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF428	Q96B54	188 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	NYX	Q9GZU5	481 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ST5	P78524	1137 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TCIRG1	Q13488	830 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	NPHP1	O15259	732 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PDE6B	P35913	854 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		18.77	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	SLC4A2	P04920	1241 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	18.75	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	CHD4	Q14839	1912 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	GRIN3B	O60391	1043 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	DPEP1	P16444	411 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	PIM2	Q9P1W9	311 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241		H0YIN7	160 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	NTSR2	O95665	410 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	KCNA3	P22001	575 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	GPT	P24298	496 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	GPR162	Q16538	588 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	KSR2	Q6VAB6	950 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0G2JLW4	131 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	FLII	Q13045	1269 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	SUSD4	Q5VX71	490 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	NLRP10	Q86W26	655 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PTPA-222	ENST00000445241	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PTPA-222	ENST00000445241	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		18.7	■□□□□ 0.58

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