RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 RAI14Q9P0K7 980 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TRPM2O94759 1503 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ZBTB9Q96C00 473 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TMC6Q7Z403 805 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 NME9Q86XW9 330 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 STX6O43752 255 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 KCNA6P17658 529 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 SHTN1A0MZ66 631 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 BIN1O00499 593 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ATP2B2Q01814 1243 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 UVSSAQ2YD98 709 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 GBP3Q9H0R5 595 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 STK32BQ9NY57 414 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 RAB11FIP3O75154 756 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TMX3Q96JJ7 454 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TNNQ9UQP3 1299 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 GJB2P29033 226 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 SOGA3Q5TF21 947 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TXLNAP40222 546 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 METTL24Q5JXM2 366 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 MYO6Q9UM54 1294 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.61□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 UBE2HP62256 183 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CNPY2Q9Y2B0 182 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 MYO1BO43795 1136 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 LDHCP07864 332 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 SLC5A1P13866 664 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 KIAA1328Q86T90 577 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 F6X3S4 739 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 KIF5CO60282 957 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 USP48Q86UV5 1035 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 NEMFO60524 1076 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 PPFIA3O75145 1194 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 MAPKBP1O60336 1514 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 IL2RBP14784 551 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CCDC148Q8NFR7 591 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 ISM2Q6H9L7 571 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 MCM10Q7L590 875 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 FSIP1Q8NA03 581 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS3-204ENST00000428457 KRT32Q14532 448 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 IQCEQ6IPM2 695 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 NYXQ9GZU5 481 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 TTC22Q5TAA0 569 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 ERLIN2O94905 339 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 SKILP12757 684 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 NUCB1Q02818 461 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 TICAM2Q86XR7 235 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 CEP170Q5SW79 1584 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 LIG1P18858 919 aa11.57□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 EIF5P55010 431 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 GSDMDP57764 484 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms