RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424529.6

VGLL4-208, Transcript of vestigial like family member 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL4, Length 1,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VGLL4-208	ENST00000424529	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
VGLL4-208	ENST00000424529	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		27.89	■■■□□ 2.06
VGLL4-208	ENST00000424529	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		27.88	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	SERPINB2	P05120	415 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	COPS6	Q7L5N1	327 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	ATP10D	Q9P241	1426 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VGLL4-208	ENST00000424529	VAMP4	O75379	141 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	GOLGA2	Q08379	1002 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	KLHL34	Q8N239	644 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	NUP98	P52948	1817 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	HYPK	Q9NX55	129 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	TGFB2	P61812	414 aa		27.8	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.8	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.8	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.8	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		27.79	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.79	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.78	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.78	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529		E9PSI1	815 aa		27.77	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	KCNA3	P22001	575 aa		27.77	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04
VGLL4-208	ENST00000424529	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		27.76	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.75	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		27.75	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.74	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	DPEP1	P16444	411 aa		27.73	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		27.73	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529		A0A0G2JLW4	131 aa		27.72	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.71	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.71	■■■□□ 2.03
VGLL4-208	ENST00000424529	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	27.7	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	SUSD4	Q5VX71	490 aa		27.7	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.7	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		27.7	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	G2E3	Q7L622	706 aa		27.69	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	NTSR2	O95665	410 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	SLC4A2	P04920	1241 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	GPT	P24298	496 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	CHRNA5	P30532	468 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.67	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	STK31	Q9BXU1	1019 aa		27.67	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		27.67	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	UTRN	P46939	3433 aa		27.66	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.66	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	NLRP10	Q86W26	655 aa		27.66	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	CACNA1F	O60840	1977 aa		27.65	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.65	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ADCY9	O60503	1353 aa		27.64	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ST5	P78524	1137 aa		27.64	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.64	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.64	■■■□□ 2.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.63	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	PDE6B	P35913	854 aa		27.63	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.63	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.62	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	GPR162	Q16538	588 aa		27.62	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.62	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	KSR2	Q6VAB6	950 aa		27.62	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		27.62	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	FLII	Q13045	1269 aa		27.61	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		27.61	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		27.61	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		27.61	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.61	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	PIM2	Q9P1W9	311 aa		27.61	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	SRGN	P10124	158 aa		27.6	■■■□□ 2.01
VGLL4-208	ENST00000424529	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01

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