RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419348.6

HTATIP2-201, Transcript of HIV-1 Tat interactive protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HTATIP2, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATIP2-201ENST00000419348 CHD4Q14839 1912 aa28.33■■■□□ 2.13
HTATIP2-201ENST00000419348 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
HTATIP2-201ENST00000419348 E9PSI1 815 aa28.33■■■□□ 2.13
HTATIP2-201ENST00000419348 PROSER3Q2NL68 480 aa28.33■■■□□ 2.13
HTATIP2-201ENST00000419348 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.33■■■□□ 2.13
HTATIP2-201ENST00000419348 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.33■■■□□ 2.13
HTATIP2-201ENST00000419348 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.33■■■□□ 2.13
HTATIP2-201ENST00000419348 ANXA1P04083 346 aa28.32■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 NFIXQ14938 502 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 HYPKQ9NX55 129 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 SLFN5Q08AF3 891 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 TGFB2P61812 414 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 DDR1Q08345 913 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 COPS6Q7L5N1 327 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 VAMP4O75379 141 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATIP2-201ENST00000419348 SCN7AQ01118 1682 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 HLFQ16534 295 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 SETDB2Q96T68 719 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 STK31Q9BXU1 1019 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 SERPINB2P05120 415 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 BCORQ6W2J9 1755 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 A0A0G2JLW4 131 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 C1QTNF8P60827 252 aa28.21■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
HTATIP2-201ENST00000419348 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.2■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.2■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.19■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 SLC4A2P04920 1241 aa28.18■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 DPEP1P16444 411 aa28.17■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.17■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.17■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 BCS1LQ9Y276 419 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 ATP10DQ9P241 1426 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.15■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 NUP98P52948 1817 aa28.15■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.14■■■□□ 2.1
HTATIP2-201ENST00000419348 TCIRG1Q13488 830 aa28.14■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.14■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 NPHP1O15259 732 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 KCNA3P22001 575 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 GPTP24298 496 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 CNBD1Q8NA66 436 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF428Q96B54 188 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.12■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 PARP10Q53GL7 1025 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 G2E3Q7L622 706 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 NYXQ9GZU5 481 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 PIM2Q9P1W9 311 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 CACNA1FO60840 1977 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM177BA6PVY3 158 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 ST5P78524 1137 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 FLIIQ13045 1269 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 ADCY9O60503 1353 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 SUSD4Q5VX71 490 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 KSR2Q6VAB6 950 aa28.08■■■□□ 2.09
HTATIP2-201ENST00000419348 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.06■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 NLRP10Q86W26 655 aa28.06■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.06■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.06■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 PDE6BP35913 854 aa28.05■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.05■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.05■■■□□ 2.08
HTATIP2-201ENST00000419348 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms