RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRM-202ENST00000400053 NUCB1Q02818 461 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1328Q86T90 577 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRM-202ENST00000400053 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRM-202ENST00000400053 ABCC2Q92887 1545 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRM-202ENST00000400053 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRM-202ENST00000400053 EIF5P55010 431 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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PTPRM-202ENST00000400053 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRM-202ENST00000400053 SHTN1A0MZ66 631 aa10.28□□□□□ -0.76
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PTPRM-202ENST00000400053 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.28□□□□□ -0.76
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PTPRM-202ENST00000400053 CEP135Q66GS9 1140 aa10.27□□□□□ -0.76
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PTPRM-202ENST00000400053 V9GYY5 206 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
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PTPRM-202ENST00000400053 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRM-202ENST00000400053 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRM-202ENST00000400053 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRM-202ENST00000400053 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRM-202ENST00000400053 KIF20AO95235 890 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRM-202ENST00000400053 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.25□□□□□ -0.77
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